El día 28 de Febrero de 1996 se inician labores en la ciudad de Neiva y en las seccionales.
En el año del 2005 se establece convenio tripartito entre el Ministerio de Educación Nacional, la Gobernación del Departamento del Huila y El Colegio Ateneo Autónomo de Colombia para ofrecer el servicio educativo a población vulnerable (rural dispersa y desplazada).
En el año 2007 se da apertura a los programas de educación para el Trabajo y Desarrollo Humano y los niveles de preescolar y primaria; igualmente se establece convenio con el ICBF y el Ministerio de Educación Nacional para la atención al a primera infancia.